45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1288 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  348  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  62.5 
 
 
156 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  52.87 
 
 
162 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  32.48 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  27.35 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  27.95 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  32.26 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  30.88 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.17 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  26.87 
 
 
173 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  37.23 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  26.71 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  31.67 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  31.67 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  31.67 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  30.83 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  29.82 
 
 
255 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  28.7 
 
 
287 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  33.68 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  34.07 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  30.25 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  33.94 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  32.17 
 
 
276 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  34.09 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  34.09 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  30.43 
 
 
255 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  34.09 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.7 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  32.56 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  27.73 
 
 
253 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  26.89 
 
 
287 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  27.12 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  28.72 
 
 
125 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  32.95 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  25.41 
 
 
254 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  26.19 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  26.89 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  30.85 
 
 
125 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  24.17 
 
 
288 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  27.59 
 
 
141 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>