96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0915 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  60.31 
 
 
141 aa  173  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  36.76 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  34.59 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  31.85 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  36.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  33.61 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  31.34 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  36.84 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  36.84 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  31.06 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.56 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  34.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.82 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  31.48 
 
 
182 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  32.81 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  35.79 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.03 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  28.3 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.56 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  32.69 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  32.69 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  31.34 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  31.11 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  31.68 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  31.68 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  31.5 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  31.37 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  31.73 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  28.95 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  32.26 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  29.32 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  30.77 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  32.35 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  26.24 
 
 
144 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  28.07 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  38.96 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  30.3 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  29.92 
 
 
173 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  29.81 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  30 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  30.28 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  26.32 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  27.72 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  30.69 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  29.46 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  26.02 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  26.12 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  34.62 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  36.49 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  25.44 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  26.21 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  27.5 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  25.69 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  25.69 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  28.87 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  40.3 
 
 
332 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  29.29 
 
 
139 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  32.81 
 
 
157 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  32.14 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  40.43 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  26.19 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
163 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3667  hypothetical protein  26.09 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  25.42 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61270  hypothetical protein  28.43 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  27.74 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  25.64 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5277  hypothetical protein  28.43 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.4 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  26.67 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  26.12 
 
 
284 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  39.13 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  26.52 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  29 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  26.67 
 
 
174 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  26.67 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  32.86 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  29.17 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  27.21 
 
 
153 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>