40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  35.38 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  34.62 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  34.07 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  36.76 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  32.45 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  34.59 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  32.14 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  34.06 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.29 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  32.59 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  34.78 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  34.78 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  33.83 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  31.58 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  34.07 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  34.62 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  36.94 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  30.6 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  31.73 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  28.1 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  24.81 
 
 
254 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  30.51 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  33.94 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  26.8 
 
 
276 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  26.03 
 
 
288 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  25.29 
 
 
253 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  30.33 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  38.78 
 
 
247 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  32.28 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.1 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  34.88 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  26.95 
 
 
288 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  24.8 
 
 
255 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>