45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2199 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  65.45 
 
 
288 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  62.59 
 
 
287 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  60.76 
 
 
287 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  60.39 
 
 
253 aa  323  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  61.11 
 
 
255 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  43.19 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  43.31 
 
 
253 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  49.79 
 
 
276 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  41.74 
 
 
254 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.33 
 
 
280 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  37.08 
 
 
247 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.89 
 
 
255 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  39.55 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  32.19 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  32.76 
 
 
155 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  30.83 
 
 
174 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  34.15 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  31.58 
 
 
174 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.09 
 
 
175 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  35.54 
 
 
127 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  31.82 
 
 
157 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  30.88 
 
 
160 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  36.67 
 
 
125 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  33.63 
 
 
130 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  29.08 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  30.6 
 
 
157 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  35.79 
 
 
157 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  35.79 
 
 
157 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  35.79 
 
 
157 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  36.89 
 
 
162 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  36.89 
 
 
162 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  32.77 
 
 
125 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  26.5 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  27.08 
 
 
155 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  26.03 
 
 
133 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  31 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  24.58 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.93 
 
 
131 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  24.17 
 
 
170 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>