46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3038 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  527  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  54 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  46.4 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 287 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  47.24 
 
 		 288 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  46.64 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  43.31 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  37 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  35.22 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  39.84 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  30.12 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  30.95 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  33.61 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  32.23 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  31.93 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  37.3 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  37.3 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  37.3 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  32.46 
 
 		 157 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  32.46 
 
 		 157 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  33.64 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  34.74 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  23.53 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  29.69 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  27.68 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  30.23 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  30.23 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  27.87 
 
 		 127 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  28.33 
 
 		 125 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  28.07 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  30.23 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  31.01 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  29.17 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  27.18 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  25.29 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  27.73 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.19 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.83 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.93 
 
 		 131 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>