41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0616 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  62.5 
 
 		 170 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  61.27 
 
 		 162 aa  183  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  43.36 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  35.71 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  34.15 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  34.19 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  35.29 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  28.81 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  28.21 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  29.73 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  28.32 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  29.46 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  27.68 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  30.09 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  26.89 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  32.17 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  30.19 
 
 		 253 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  25.98 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  34.88 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  24.58 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  30.4 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  29.9 
 
 		 173 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  24.58 
 
 		 254 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  28.23 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>