135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0316 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
138 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  32.35 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  37.98 
 
 
187 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  33.09 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  36.03 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  36.03 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  39.36 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  35.59 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  37.88 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  40.38 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  36.72 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  35.92 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  34.56 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  36.64 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  39.62 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  34.38 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  35.11 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  36 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  38.04 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  38.04 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  38 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  37.39 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  32.73 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  31.11 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  39.74 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  31.34 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  33.88 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  29.63 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  35.54 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  29.01 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  35.87 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  29.41 
 
 
284 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.36 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  29.67 
 
 
212 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  25.95 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  30.11 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  30.91 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  30.91 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  28.95 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  29.03 
 
 
179 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  27.96 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  25.4 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  29.03 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  30.11 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  26.12 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  29.03 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  28.26 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  28.26 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  28.26 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  27.96 
 
 
214 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  35.8 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  35.44 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  25.93 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  27.52 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  36 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  25.81 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  28.07 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.28 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.37 
 
 
316 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  29.36 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  37.93 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  39.22 
 
 
331 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  29.25 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
402 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  27.42 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  35 
 
 
172 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  32.05 
 
 
174 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  26.02 
 
 
151 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  30.99 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  32.05 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  23.13 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  24.62 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  30.61 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  25.2 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  25.2 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  25.2 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  39.06 
 
 
332 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  25.36 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>