34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3812 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  100 
 
 		 280 aa  590  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  40.4 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  36.03 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  40.91 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  41.15 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  36.33 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  35.55 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  33.78 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  32.58 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  27.04 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  22.86 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  37.93 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  30.97 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  36.9 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  36.9 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  29.2 
 
 		 125 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  31.71 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  35.44 
 
 		 158 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  36.25 
 
 		 158 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  36.25 
 
 		 158 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.18 
 
 		 175 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  28.87 
 
 		 174 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  35 
 
 		 160 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  31.71 
 
 		 174 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  34.18 
 
 		 158 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  27.7 
 
 		 174 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>