105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0284 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  98.17 
 
 		 328 aa  658    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  45.99 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  42.01 
 
 		 350 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  33 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  37.58 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  35.54 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  32.49 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  35.74 
 
 		 450 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  35.27 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 442 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  31.96 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  24.67 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  21.2 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 404 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  21.59 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  22.05 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 390 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.18 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.8 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  22.31 
 
 		 371 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 407 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  30.25 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.48 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0525  hypothetical protein  25.78 
 
 		 168 aa  49.7  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000120014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.36 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  30.65 
 
 		 498 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  22.47 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  22.4 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  21 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  21 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0287  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.96 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  22.71 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  28.49 
 
 		 498 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  22.89 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 		 271 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 427 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  22.07 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  27.48 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  31.73 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  28.47 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  24.56 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.9 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.5 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  20.38 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  29.01 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0429  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.398543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  24.75 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  26.8 
 
 		 702 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  21.33 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  24.53 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.03 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  26.85 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 397 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>