81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2027 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  100 
 
 		 481 aa  972    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  39.06 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  32.57 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  32.48 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 454 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  33.03 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  32.4 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  27.02 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  32.99 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  38.14 
 
 		 340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.7 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.25 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  24.79 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.98 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.17 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  31.36 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.4 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.51 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.62 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.16 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.28 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.87 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.16 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.95 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  23.4 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.18 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.18 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.85 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.33 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.28 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.77 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.3 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.98 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.84 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.39 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.47 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.05 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  23.05 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.15 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  24.36 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.59 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.09 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.58 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.95 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.46 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.27 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.45 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.88 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.36 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.17 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.17 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  22.84 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.48 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  23.81 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.98 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  21.26 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.9 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.95 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  26.18 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.54 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  22.02 
 
 		 506 aa  43.5  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.07 
 
 		 480 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  24.75 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  26.18 
 
 		 344 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.97 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.67 
 
 		 505 aa  43.5  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.29 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>