241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2222 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  100 
 
 
433 aa  858    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  39.06 
 
 
481 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  34.47 
 
 
328 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  32.34 
 
 
450 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  33.42 
 
 
328 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  35.15 
 
 
467 aa  217  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 
451 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  32.48 
 
 
454 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  33.91 
 
 
350 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  33.02 
 
 
340 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  30.98 
 
 
342 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  30.79 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  44.44 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 
509 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.04 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  27.01 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.8 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.16 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.16 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.13 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  27.21 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.34 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.39 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  21.69 
 
 
457 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  21.69 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  22.31 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.31 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.23 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.84 
 
 
480 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.47 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.92 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  23.81 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.03 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  22.06 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.71 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.84 
 
 
479 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.44 
 
 
473 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.02 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.84 
 
 
473 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.56 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.03 
 
 
453 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  19.78 
 
 
504 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.07 
 
 
390 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  21.61 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  21.98 
 
 
442 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.19 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.94 
 
 
488 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.69 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  25.69 
 
 
567 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.69 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  24.78 
 
 
395 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.26 
 
 
514 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
473 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  25.14 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.3 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  23.92 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.43 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.27 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  24.48 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  25 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.81 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.36 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.46 
 
 
442 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  26.69 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.47 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.2 
 
 
453 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  23.95 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.74 
 
 
442 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.2 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.65 
 
 
511 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.68 
 
 
487 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.78 
 
 
448 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.72 
 
 
474 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.9 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.6 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.23 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  29.21 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.35 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.12 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.87 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.96 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.69 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.81 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  28.87 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.43 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  21.67 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.46 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.89 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  21.88 
 
 
508 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  21.88 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  22.19 
 
 
506 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  23.4 
 
 
523 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  22.6 
 
 
436 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.96 
 
 
480 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.31 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  24.05 
 
 
469 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  25.37 
 
 
446 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>