224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06475 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  959    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  59.13 
 
 		 451 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  45 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  42.05 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  35.15 
 
 		 433 aa  229  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  33.49 
 
 		 481 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  28.36 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.65 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  32.88 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  33.17 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  28.81 
 
 		 342 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.62 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.58 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  26.9 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.03 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  24.44 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.47 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.91 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.65 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.43 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.1 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.95 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.62 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.99 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.99 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.29 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.05 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.05 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  21.11 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.21 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.36 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.84 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.64 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.05 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  23.04 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  22.99 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.89 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  21.75 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.97 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.04 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.61 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  24.08 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.78 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.53 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.8 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.03 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.63 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.14 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.14 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.14 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.14 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  22.5 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.92 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.88 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.1 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.86 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  24.59 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.12 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.53 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.04 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.1 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.77 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.39 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.51 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.37 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.45 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.6 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  22.38 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.66 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.05 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.53 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  21.29 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.43 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  21.6 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  19.94 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.04 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.17 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.13 
 
 		 481 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  22.37 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.16 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.12 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  20.81 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  20.81 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  20.42 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  20.81 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.13 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.45 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  22.51 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  22.58 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  21.24 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.1 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  20.71 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  23.8 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  21.93 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.96 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>