201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00633 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  100 
 
 		 350 aa  707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  55.88 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  42 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  42.38 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  40.06 
 
 		 371 aa  232  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  38.89 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 433 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 450 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  32.4 
 
 		 481 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  29.23 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  28.12 
 
 		 467 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 454 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  30.32 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.9 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.53 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  27.15 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.88 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.25 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  29.06 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  32.67 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  34.67 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  33.8 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  34.21 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  34.67 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  34 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  34 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  34 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  34 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  31.77 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  34 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  24 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 440 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.47 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.25 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  34 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.49 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  30.19 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  25.24 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  30.19 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  30.22 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  25.49 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  30.19 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  29.29 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.58 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  32.41 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 417 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  32 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.16 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  23.51 
 
 		 411 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.98 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.98 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  28.49 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 397 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.98 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 414 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  30.22 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  31.75 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.92 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  35.17 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  31.03 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  23.12 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  27.97 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  28.72 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  23.03 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.15 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.7 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>