142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0283 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  100 
 
 		 342 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  56.25 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  36.88 
 
 		 371 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  35.17 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  36.88 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  36.45 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 433 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 481 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 454 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  28.81 
 
 		 467 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 		 451 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.35 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  29.73 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.38 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.23 
 
 		 394 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  29.93 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 416 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.52 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.52 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.28 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.92 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2200  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.353788  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  24.86 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  22.64 
 
 		 431 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.11 
 
 		 431 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.12 
 
 		 460 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.69 
 
 		 460 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  22.64 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  22.64 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  22.64 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  22.64 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  22.64 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  23.85 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  23.85 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.26 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.31 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.65 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  23.85 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  28.92 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.36 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  22.41 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  29.79 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  26.22 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.38 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  28.22 
 
 		 449 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  22.78 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.78 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.78 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.4 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  23.88 
 
 		 498 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.21 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.87 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  24.15 
 
 		 456 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.88 
 
 		 460 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.01 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.59 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.09 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  27.63 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  24.56 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  21.13 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  28.98 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  28.32 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>