More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1848 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  100 
 
 		 456 aa  919    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  71.87 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  71.43 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 469 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  65.27 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  66 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  61.15 
 
 		 464 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  63.94 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  65.32 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  62.33 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  62.33 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  64.59 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  64.18 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  64.3 
 
 		 459 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  64.79 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  63.3 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  63.56 
 
 		 458 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  61.93 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  63.96 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  63.03 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  61.88 
 
 		 456 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  63.3 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  63.52 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  61.86 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  63.08 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  64.04 
 
 		 462 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  59.65 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  60.66 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  60.62 
 
 		 463 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  59.29 
 
 		 459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  59.38 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  61.64 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  62.08 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  57.08 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  60.98 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  57.3 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  58.67 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  57.17 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  55.24 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  57.33 
 
 		 472 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  57.14 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  55.19 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  58.59 
 
 		 476 aa  474  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  55.33 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  61.78 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  55.87 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  54.2 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  55.19 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  58 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  54.57 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  57.3 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  57.68 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.3 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  54.55 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  54.85 
 
 		 468 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  55.51 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  55.75 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  58.22 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  55.09 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  52.88 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  51.42 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  57.96 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.65 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.08 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  55.26 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  54.89 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  48.36 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  48.36 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>