More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3595 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  76.74 
 
 
475 aa  747    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  100 
 
 
480 aa  978    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  80.22 
 
 
468 aa  773    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  92.7 
 
 
469 aa  874    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  79.83 
 
 
469 aa  776    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  56.93 
 
 
468 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  56.16 
 
 
472 aa  531  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  58.04 
 
 
467 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  58.89 
 
 
459 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  54.76 
 
 
463 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  55.19 
 
 
462 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  53.41 
 
 
464 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  53.41 
 
 
464 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  53.28 
 
 
469 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  53.41 
 
 
464 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  53.78 
 
 
463 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  53.63 
 
 
464 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  53.19 
 
 
464 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.75 
 
 
465 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  53.19 
 
 
464 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  53.55 
 
 
469 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  53.07 
 
 
464 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.48 
 
 
474 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  53.49 
 
 
466 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.31 
 
 
631 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  50.87 
 
 
461 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  50.87 
 
 
461 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.77 
 
 
463 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.41 
 
 
464 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  52.87 
 
 
471 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  51.65 
 
 
467 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  50.87 
 
 
461 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  51.88 
 
 
462 aa  476  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.87 
 
 
473 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.69 
 
 
464 aa  478  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  51.65 
 
 
467 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.55 
 
 
471 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  52.09 
 
 
465 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  54.97 
 
 
473 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  54.84 
 
 
472 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  54.97 
 
 
473 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.64 
 
 
462 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.87 
 
 
466 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.43 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  52.83 
 
 
467 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  51.42 
 
 
510 aa  472  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  51.43 
 
 
467 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  51.09 
 
 
462 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  54.97 
 
 
473 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  52.21 
 
 
472 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  52.45 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  50.44 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  51.32 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  54.17 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  54.01 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50 
 
 
466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  54 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  52.89 
 
 
474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50.44 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2328  fumarate hydratase  52.3 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  52.7 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.1 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  52.53 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50.77 
 
 
463 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  51.21 
 
 
467 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  51.75 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  50.22 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  50.55 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.22 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  48.58 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  49.89 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.33 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  52.4 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.09 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  53.91 
 
 
471 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  49.12 
 
 
462 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50 
 
 
467 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  50.98 
 
 
462 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  49.34 
 
 
464 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  52.41 
 
 
466 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  49.78 
 
 
461 aa  462  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  50.21 
 
 
471 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  49.34 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  48.68 
 
 
459 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  53.36 
 
 
466 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  51.65 
 
 
465 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>