More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3686 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  100 
 
 		 463 aa  946    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  67.4 
 
 		 457 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  68.91 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  69.13 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  68.85 
 
 		 458 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  69.13 
 
 		 458 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  69.57 
 
 		 459 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  68.91 
 
 		 459 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  69.82 
 
 		 448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  68.48 
 
 		 459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  68.04 
 
 		 458 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  67.82 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  67.17 
 
 		 458 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 457 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  61.69 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  61.64 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  63.26 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  61.09 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  62.83 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  61.17 
 
 		 456 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  61.93 
 
 		 456 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  60.17 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  59.4 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.01 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.71 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 460 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  56.11 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  57.68 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  53.16 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.21 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  52.37 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  49.13 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  49.89 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  50.68 
 
 		 463 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  48.9 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  49.35 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  49.32 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 463 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  51.36 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  49.68 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  52.02 
 
 		 466 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  48.93 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  46.39 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  49.35 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  47.38 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  48.81 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  51.32 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  46.09 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  46.85 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  48.29 
 
 		 473 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  48.84 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  48.73 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  48.16 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  45.24 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  45.24 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  46.37 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.73 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  45.2 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  45.63 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  46.15 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  48.5 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  45.51 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  44.98 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  48.5 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  48.5 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  47.91 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  46.48 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  48.5 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  48.72 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  44.98 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 465 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  46.48 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  47.63 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  48.84 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  48.5 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>