More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0959 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  80.34 
 
 		 471 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  72.03 
 
 		 473 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  72.65 
 
 		 462 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  69.63 
 
 		 464 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  74.73 
 
 		 473 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  70.02 
 
 		 463 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  88.53 
 
 		 476 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  71.02 
 
 		 472 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  75.11 
 
 		 471 aa  685    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 465 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  74.68 
 
 		 475 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  100 
 
 		 473 aa  951    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  84.14 
 
 		 473 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  74.46 
 
 		 473 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  77.09 
 
 		 468 aa  710    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  68.04 
 
 		 463 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.55 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  70.15 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  69.37 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  67.47 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  70.46 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  68.63 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  66.17 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  66.38 
 
 		 466 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  69.28 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  64.88 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  64.21 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  64.55 
 
 		 466 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  63.64 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  63.85 
 
 		 473 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  63.64 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  65.94 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  62.96 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  56.46 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  57.37 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  59.52 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.78 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  57.96 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.68 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.47 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  52.48 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.36 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  54.98 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.04 
 
 		 475 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  53.85 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.65 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.65 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  53.13 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.68 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.16 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.68 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.69 
 
 		 631 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.94 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  53.64 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.07 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  53.41 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  52.71 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  49.56 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.79 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.79 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  51.06 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  51.19 
 
 		 461 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.35 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  49.03 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  49.44 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  52.25 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  49.11 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  50.9 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  52.27 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  50.9 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  48.57 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  52.7 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>