More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1252 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  73.18 
 
 		 471 aa  681    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  100 
 
 		 475 aa  964    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  69.4 
 
 		 462 aa  656    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  68.97 
 
 		 463 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  71.91 
 
 		 468 aa  665    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  76.71 
 
 		 473 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  71.03 
 
 		 471 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  80.73 
 
 		 473 aa  732    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  71.86 
 
 		 465 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  75.75 
 
 		 476 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  93.05 
 
 		 473 aa  883    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  74.68 
 
 		 473 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  68.45 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  66.38 
 
 		 465 aa  614  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  68.24 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  67.16 
 
 		 463 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  68.23 
 
 		 463 aa  601  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  65.02 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  63.95 
 
 		 464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  66.74 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  65.09 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  63.66 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  65.59 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  64.95 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  64.3 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  63.58 
 
 		 471 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  64.01 
 
 		 472 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  63.07 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  62.93 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  64.22 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  64.44 
 
 		 473 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  64.22 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  63.36 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.76 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  52.16 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  55.58 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.14 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  50.75 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  53.46 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  54.55 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  51.29 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  51.29 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  52.68 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.81 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 475 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  54.86 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  54.3 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  54.39 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  52.36 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.03 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.79 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  51.92 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  51.01 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.53 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  51.69 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.02 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.15 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  49.25 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.9 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.01 
 
 		 470 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  50.79 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  50.56 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.01 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.23 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  51.34 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.05 
 
 		 460 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  51.69 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.89 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.46 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  51.11 
 
 		 466 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  50.34 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  47.65 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 631 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50.9 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  48.93 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>