More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2040 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  97.84 
 
 		 465 aa  942    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  84.27 
 
 		 467 aa  793    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  84.48 
 
 		 467 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  87.5 
 
 		 465 aa  851    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  72.57 
 
 		 463 aa  703    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  75.6 
 
 		 461 aa  732    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  83.15 
 
 		 467 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  76.09 
 
 		 463 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  83.15 
 
 		 467 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  73.86 
 
 		 461 aa  723    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  84.95 
 
 		 465 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  83.15 
 
 		 467 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  84.48 
 
 		 467 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  71.99 
 
 		 463 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  74.07 
 
 		 464 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  75.87 
 
 		 463 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  72.98 
 
 		 464 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  73.64 
 
 		 464 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  84.48 
 
 		 467 aa  798    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  73.64 
 
 		 461 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  100 
 
 		 465 aa  961    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  84.95 
 
 		 465 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  73.9 
 
 		 462 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 466 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  72.98 
 
 		 464 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  73.86 
 
 		 461 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  84.27 
 
 		 467 aa  813    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  84.05 
 
 		 467 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  72.98 
 
 		 464 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  84.27 
 
 		 467 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  72.39 
 
 		 474 aa  688    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  72.71 
 
 		 466 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  83.15 
 
 		 467 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  74.24 
 
 		 463 aa  741    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  74.13 
 
 		 468 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  83.15 
 
 		 467 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  84.27 
 
 		 467 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  85.78 
 
 		 464 aa  833    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  87.1 
 
 		 465 aa  846    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  84.52 
 
 		 470 aa  819    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  84.27 
 
 		 467 aa  793    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  72.45 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  73.36 
 
 		 465 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  73.2 
 
 		 464 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  71.77 
 
 		 469 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  85.16 
 
 		 465 aa  840    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  73.36 
 
 		 631 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  64.43 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  64.33 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  63.89 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  62.45 
 
 		 463 aa  601  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  65.65 
 
 		 468 aa  594  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  61.27 
 
 		 463 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  61.05 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  61.09 
 
 		 471 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.09 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.09 
 
 		 463 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  61.99 
 
 		 466 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  61.18 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  61.82 
 
 		 462 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  61.18 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  61.98 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  61.99 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  61.69 
 
 		 465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  61.76 
 
 		 464 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  60.7 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4786  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 461 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  60.92 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  61.87 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  60.61 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  62.14 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  61.18 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  63.34 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  60.75 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  61.21 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  60.18 
 
 		 472 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  59.96 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  59.61 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  58.61 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  60.39 
 
 		 469 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  59.96 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>