More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2065 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  100 
 
 		 469 aa  953    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  92.04 
 
 		 473 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  91.83 
 
 		 473 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  85.9 
 
 		 474 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  84.06 
 
 		 466 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  91.83 
 
 		 473 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  83.41 
 
 		 472 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  96.11 
 
 		 471 aa  885    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  67.4 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 463 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  64.99 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  64.13 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  62.96 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  64.58 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  63.44 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  61.61 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  64.27 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  64.27 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  63.18 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  62.93 
 
 		 475 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  62.07 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  62.75 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  62.8 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  60.91 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  59.66 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  62.69 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  62.69 
 
 		 471 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  62.31 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  62.06 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  59.39 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.56 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  54 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.78 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.14 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.09 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  53.17 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  54.75 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.43 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.51 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  52.41 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  52.11 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.38 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  51.99 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 468 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  54.49 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.44 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.55 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.43 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  49.89 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  50.91 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  49.14 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  50.65 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.77 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  49.13 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>