More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0748 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  100 
 
 		 467 aa  955    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  62.39 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  61.61 
 
 		 468 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  58.04 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  58.35 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  57.97 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  59.05 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  56.33 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  58 
 
 		 459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  57.02 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  54.88 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  55.6 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  58.96 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  56.28 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  55.94 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  56.74 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  54.78 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  54.84 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  54.21 
 
 		 473 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  53.04 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  56.37 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  53.55 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  53.8 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 474 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.39 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  54.86 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  53.53 
 
 		 475 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.53 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  54.72 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  56.34 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  53.36 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  53.24 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  53.24 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.19 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  53.06 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  54.08 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  54.21 
 
 		 473 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  53.06 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  55.91 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.65 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  52.35 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 461 aa  478  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  51.86 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  52.57 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  56.13 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  52.57 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  52.35 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  55.19 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  52.3 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  52.35 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  54.08 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.78 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  53.54 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  51.43 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.79 
 
 		 474 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  54.11 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>