More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8511 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  72.11 
 
 		 463 aa  634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  75 
 
 		 464 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  72.27 
 
 		 465 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  72.55 
 
 		 463 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  72.77 
 
 		 462 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  71.46 
 
 		 473 aa  649    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  71.96 
 
 		 472 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  71.62 
 
 		 464 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  71.46 
 
 		 463 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  73.3 
 
 		 464 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  100 
 
 		 463 aa  940    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  69.13 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  69.37 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  69.21 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  69.21 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  70.37 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  69.35 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  67.4 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  69.41 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.78 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  67.31 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  68.04 
 
 		 473 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  65.02 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  66.16 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  69.43 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  64.99 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  63.04 
 
 		 471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  63.46 
 
 		 472 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  63.12 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  60.62 
 
 		 456 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  58.64 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  57.02 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  56.03 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  60.17 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  58.42 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  54.55 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.78 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  55.43 
 
 		 475 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  55.05 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.19 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.68 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  55.34 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  58.41 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  54.47 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.84 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  55.73 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  52.06 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.62 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  57.05 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  55.73 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  53.12 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.16 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  54.9 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  55.73 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  51.84 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  55.29 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  52.82 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  53.13 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.18 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.22 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  49.45 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  52.7 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  52.61 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.47 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 461 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  54.18 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>