More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05170 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  71.46 
 
 
465 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  73.61 
 
 
468 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  68.09 
 
 
472 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  67.53 
 
 
463 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  100 
 
 
473 aa  967    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  71.12 
 
 
471 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  68.6 
 
 
462 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  80.73 
 
 
475 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  75 
 
 
473 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  72.03 
 
 
473 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  72.23 
 
 
471 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  81.29 
 
 
473 aa  761    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  74.25 
 
 
476 aa  665    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  66.74 
 
 
465 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  65.8 
 
 
466 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  65.23 
 
 
466 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  66.74 
 
 
473 aa  614  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  66.81 
 
 
463 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  65.8 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  63.58 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  67.45 
 
 
463 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  62.72 
 
 
463 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  62.2 
 
 
465 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  63.19 
 
 
472 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  62.28 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  62.31 
 
 
466 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  61.1 
 
 
473 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  60.89 
 
 
473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  60.89 
 
 
473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  60.61 
 
 
471 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  59.66 
 
 
469 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  62.66 
 
 
464 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  60.78 
 
 
472 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  58.86 
 
 
474 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  58.41 
 
 
463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.55 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.96 
 
 
469 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  51.84 
 
 
480 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.04 
 
 
475 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  54.57 
 
 
456 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.92 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.14 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  51.62 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  54.31 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  51.93 
 
 
469 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.8 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.21 
 
 
461 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  54.19 
 
 
463 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.52 
 
 
468 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.21 
 
 
461 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  49.79 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  52.63 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.36 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  51.41 
 
 
475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  49.79 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.99 
 
 
461 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.1 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  50.65 
 
 
469 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.1 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.1 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  51.91 
 
 
467 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.1 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.52 
 
 
464 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.3 
 
 
474 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.32 
 
 
631 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.32 
 
 
464 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.1 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.23 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.23 
 
 
463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  53.3 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.77 
 
 
463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  50.88 
 
 
467 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.16 
 
 
474 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.32 
 
 
472 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  50.88 
 
 
467 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.64 
 
 
465 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  50.88 
 
 
467 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  50.88 
 
 
467 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  50.88 
 
 
467 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  51.71 
 
 
469 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50.33 
 
 
465 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50.22 
 
 
459 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.99 
 
 
463 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  48.16 
 
 
459 aa  438  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.33 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.57 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.32 
 
 
466 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.11 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  50.11 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.89 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  48.37 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  52.24 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  50.11 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  50.22 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  50.11 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.69 
 
 
467 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  51.91 
 
 
467 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  51.69 
 
 
467 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50 
 
 
470 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  51.5 
 
 
469 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>