More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1879 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  73.68 
 
 		 462 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  70.15 
 
 		 473 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  74.24 
 
 		 464 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  73.46 
 
 		 463 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  73.86 
 
 		 472 aa  688    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  75.44 
 
 		 463 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  70.37 
 
 		 463 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  75.66 
 
 		 463 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  76.37 
 
 		 464 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  68.34 
 
 		 471 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  100 
 
 		 472 aa  955    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  70.74 
 
 		 465 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  71.93 
 
 		 464 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  70.77 
 
 		 466 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  69.96 
 
 		 471 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  69.74 
 
 		 466 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  67.31 
 
 		 473 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.52 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  69.48 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  64.95 
 
 		 475 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  68.63 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  63.52 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  63.19 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  63.38 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  65.57 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  62.72 
 
 		 466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  65.35 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  65.35 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  65.35 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  62.06 
 
 		 469 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  62.5 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  63.16 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  65.72 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  59.78 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  60.52 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.84 
 
 		 480 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  55.44 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  55.51 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  54.87 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  55.91 
 
 		 467 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.76 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  57.37 
 
 		 459 aa  481  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.95 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  57.14 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  56.21 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  54.33 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  58.22 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 475 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  56.68 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.53 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.34 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  51 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  52.31 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.38 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  52.08 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.79 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.54 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 471 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.35 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.35 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  53.79 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.54 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.98 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  53.51 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.56 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.67 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  49.56 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  53.35 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  49.89 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  50.34 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  52.21 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  49.14 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  50 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>