More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1189 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  72.84 
 
 		 467 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  70.69 
 
 		 466 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  87.31 
 
 		 465 aa  841    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  70.56 
 
 		 465 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0795  fumarate hydratase, class II  66.67 
 
 		 476 aa  643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 466 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  73.81 
 
 		 465 aa  696    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 462 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  71 
 
 		 464 aa  689    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  74.35 
 
 		 465 aa  716    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4786  fumarate hydratase  72.39 
 
 		 461 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  71.27 
 
 		 466 aa  696    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1185  fumarate hydratase, class II  69.48 
 
 		 462 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0542  fumarate hydratase, class II  66.52 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0516  fumarate hydratase, class II  66.95 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0598  fumarate hydratase, class II  66.74 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0537  fumarate hydratase, class II  66.31 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3801  fumarate hydratase, class II  65.87 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.56 
 
 		 461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  61.56 
 
 		 461 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  61.56 
 
 		 461 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  63.7 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  62.91 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 461 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  61.61 
 
 		 468 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  63.04 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  61.22 
 
 		 471 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  61.82 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  62.09 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  62.09 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  61 
 
 		 464 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  61 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  60.87 
 
 		 462 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  60.86 
 
 		 465 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  62.09 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  61 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  61 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  61.27 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  61.87 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  61.72 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  61.26 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  61.05 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  61.66 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  61.3 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  61.66 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  61.66 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  61.66 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.83 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.83 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  61.04 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  61.82 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 463 aa  557  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  61.01 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  58.01 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  59.23 
 
 		 510 aa  548  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  59.91 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  58.01 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  58.23 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  58.96 
 
 		 462 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  59.4 
 
 		 492 aa  544  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  58.86 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  58.32 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  58.53 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>