More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3332 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  74.18 
 
 		 463 aa  670    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  71.58 
 
 		 467 aa  675    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  71.58 
 
 		 467 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  73.3 
 
 		 461 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 467 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  73.3 
 
 		 461 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  71.58 
 
 		 464 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  72.23 
 
 		 470 aa  683    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  70.07 
 
 		 465 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 465 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  70.07 
 
 		 465 aa  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  71.37 
 
 		 465 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 464 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  73.96 
 
 		 464 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  72.14 
 
 		 465 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  71.37 
 
 		 467 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  74.95 
 
 		 468 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  72.49 
 
 		 462 aa  670    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  69.85 
 
 		 465 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  71.37 
 
 		 465 aa  684    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  72.65 
 
 		 461 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  72.65 
 
 		 461 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  71.58 
 
 		 467 aa  675    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 464 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 467 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  71.58 
 
 		 467 aa  675    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 467 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  71.24 
 
 		 474 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  73.09 
 
 		 466 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  71.15 
 
 		 467 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  71.58 
 
 		 467 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  71.89 
 
 		 463 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  71.37 
 
 		 467 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 464 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  72.02 
 
 		 465 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  73.96 
 
 		 466 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  71.37 
 
 		 467 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 467 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  73.74 
 
 		 464 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  72.21 
 
 		 466 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  71.8 
 
 		 467 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  74.84 
 
 		 631 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 464 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  73.74 
 
 		 463 aa  665    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 463 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  74.18 
 
 		 464 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  100 
 
 		 469 aa  951    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  74.62 
 
 		 464 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  63.04 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  67.1 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 463 aa  594  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.47 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  61.3 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  62.23 
 
 		 462 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  62.01 
 
 		 462 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.47 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  62.01 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  62.23 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  64.41 
 
 		 469 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 464 aa  579  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  62.01 
 
 		 462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  60.18 
 
 		 471 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  62.61 
 
 		 467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  64.19 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  61.79 
 
 		 472 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 475 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.7 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  61.79 
 
 		 472 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 462 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 462 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  60.95 
 
 		 474 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  61.51 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 461 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.7 
 
 		 464 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  61.99 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 461 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  61.34 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  58.52 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  59.91 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  58.95 
 
 		 465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>