More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2935 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  100 
 
 		 468 aa  957    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  67.18 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  68.71 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  67.25 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  66.67 
 
 		 474 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  66.89 
 
 		 467 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  67.83 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  68.93 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  65.8 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 461 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 461 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  68.64 
 
 		 468 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  66.89 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  65.79 
 
 		 466 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  67.11 
 
 		 631 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  65.65 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  64.77 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  67.32 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  65.43 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  67.32 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  67.32 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  67.54 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  65.65 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 464 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  67.11 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  67.11 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  67.11 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  65.14 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  65.14 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  64.77 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  64.92 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  64.33 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  64.05 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  67.1 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  65.13 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  67.11 
 
 		 467 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  64.99 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  64.99 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  65.79 
 
 		 466 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 466 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  62.06 
 
 		 463 aa  594  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  63.4 
 
 		 469 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  61.74 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  61.74 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  62.09 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  62.47 
 
 		 475 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  62.53 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 472 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  61.17 
 
 		 474 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  62.83 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  61.09 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  58.61 
 
 		 463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 472 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  59.43 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  59.43 
 
 		 459 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  60.52 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  58.37 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  61.61 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  57.99 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 462 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 478 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  56.93 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>