More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2881 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  100 
 
 
468 aa  940    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  61.79 
 
 
468 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  63.71 
 
 
466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.78 
 
 
471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  63.91 
 
 
487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  64.72 
 
 
466 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.95 
 
 
464 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  57.95 
 
 
463 aa  551  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  55.92 
 
 
459 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  57.92 
 
 
464 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  59.48 
 
 
472 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  58.11 
 
 
465 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  59.56 
 
 
463 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  55.92 
 
 
459 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  59.48 
 
 
472 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  58.57 
 
 
467 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  57.89 
 
 
465 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  58.57 
 
 
467 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  57.7 
 
 
464 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  58.11 
 
 
465 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  58.57 
 
 
467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  58.57 
 
 
467 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  58.42 
 
 
465 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  58.57 
 
 
467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  58.55 
 
 
465 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  61.09 
 
 
469 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  56.67 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  55.41 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  58.11 
 
 
465 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  59.87 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  55.53 
 
 
469 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  59.87 
 
 
461 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  59.21 
 
 
465 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  59.48 
 
 
474 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.02 
 
 
464 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  58.99 
 
 
467 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  60 
 
 
469 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  58.77 
 
 
467 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  59.13 
 
 
475 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  54.88 
 
 
461 aa  529  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  56.4 
 
 
464 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  60 
 
 
472 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  59.22 
 
 
470 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  59.04 
 
 
463 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  55.97 
 
 
464 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  58.55 
 
 
467 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  58.55 
 
 
467 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  53.49 
 
 
463 aa  526  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  57.79 
 
 
469 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  56.96 
 
 
465 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.87 
 
 
463 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  58.87 
 
 
472 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  57.61 
 
 
464 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.04 
 
 
468 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  58.55 
 
 
467 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  59.05 
 
 
468 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  56.01 
 
 
466 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  57.11 
 
 
464 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  57.33 
 
 
464 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  54.7 
 
 
510 aa  522  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  60.13 
 
 
468 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  55 
 
 
462 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  54.03 
 
 
461 aa  523  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  58.02 
 
 
474 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  56.62 
 
 
464 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.68 
 
 
461 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  54.17 
 
 
463 aa  524  1e-147  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  56.96 
 
 
462 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  57.11 
 
 
464 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  57.33 
 
 
464 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  57.11 
 
 
464 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  58.48 
 
 
469 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.68 
 
 
461 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  53.71 
 
 
463 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  55.91 
 
 
465 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  53.49 
 
 
463 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  59.13 
 
 
463 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  53.06 
 
 
463 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  57.39 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  57.45 
 
 
465 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  54.23 
 
 
467 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  57.39 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  56.46 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  57.39 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  54.35 
 
 
467 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  57.17 
 
 
464 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  56.83 
 
 
465 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  57.39 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  57.39 
 
 
464 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  57.48 
 
 
631 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  56.83 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  57.61 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.39 
 
 
462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  57.33 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  56.83 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  57.89 
 
 
461 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>