More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2365 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  100 
 
 		 470 aa  953    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  61 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  61 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.05 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  62.09 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  61.44 
 
 		 472 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  61.09 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 461 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  61.44 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 461 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.48 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  60.13 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  61.18 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.26 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  56.59 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  58.77 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.35 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  56.16 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  60.75 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  57.99 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 467 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  58.13 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  60.75 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  59 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  58.26 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  58.77 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  59.22 
 
 		 468 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  57.88 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  55.65 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  59.83 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  56.16 
 
 		 464 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  57.45 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  58.67 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  57.67 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 467 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  60.04 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  57.83 
 
 		 467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 461 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  56.25 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  57.76 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 460 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 459 aa  511  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  57.61 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  58.13 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  55.31 
 
 		 465 aa  510  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  55.94 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>