More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3242 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  100 
 
 
465 aa  954    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  70.07 
 
 
468 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  66.96 
 
 
472 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  66.74 
 
 
472 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  66.96 
 
 
472 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  65.36 
 
 
462 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  64.21 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  66.67 
 
 
469 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  64.71 
 
 
482 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  65.22 
 
 
463 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  65 
 
 
463 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  65 
 
 
478 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  65.58 
 
 
469 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  63.62 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  65.8 
 
 
469 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  65.36 
 
 
475 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  64.13 
 
 
469 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  63.7 
 
 
463 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  64.92 
 
 
472 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  61.74 
 
 
465 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  63.7 
 
 
463 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  63.04 
 
 
463 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  65.14 
 
 
472 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  61.39 
 
 
463 aa  588  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  61.89 
 
 
465 aa  584  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  62.53 
 
 
463 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  62.17 
 
 
464 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  61.51 
 
 
465 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  63.26 
 
 
463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  63.68 
 
 
461 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  61.3 
 
 
464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  63.4 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  61.82 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  61.52 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  60.48 
 
 
492 aa  575  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.595402 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  61.03 
 
 
544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  60.94 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  61.71 
 
 
461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  61.05 
 
 
463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  62.26 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  62.26 
 
 
631 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  63.48 
 
 
472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  63.56 
 
 
464 aa  571  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  61.71 
 
 
461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  62.47 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  59.22 
 
 
464 aa  566  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  61.49 
 
 
463 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  59.87 
 
 
464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  59.35 
 
 
462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  61.39 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  59.65 
 
 
463 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.13 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  61.14 
 
 
474 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  59.96 
 
 
465 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  58.7 
 
 
469 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  59.96 
 
 
464 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  59.22 
 
 
466 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  60.83 
 
 
471 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  61.05 
 
 
465 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  60.26 
 
 
461 aa  557  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  59.96 
 
 
464 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  59.57 
 
 
461 aa  553  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  60.39 
 
 
461 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59.48 
 
 
462 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.55 
 
 
464 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  59.21 
 
 
467 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  58.99 
 
 
467 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  58.86 
 
 
465 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  58.99 
 
 
467 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  58.99 
 
 
467 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  57.55 
 
 
459 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  58.86 
 
 
465 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  61.17 
 
 
464 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  60.09 
 
 
468 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  59.61 
 
 
464 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  58.64 
 
 
465 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  58.77 
 
 
467 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  58.95 
 
 
465 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  58.77 
 
 
467 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  57.55 
 
 
459 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  58.64 
 
 
465 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  58.39 
 
 
462 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  60.56 
 
 
464 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>