More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0283 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  70.07 
 
 		 465 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 468 aa  952    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  68.17 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  67.74 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  64.43 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  67.76 
 
 		 475 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  65.44 
 
 		 472 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  65.44 
 
 		 472 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  65.43 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  63.71 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  64.35 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  65.8 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  64.87 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  65.81 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  63.91 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  65.43 
 
 		 478 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  66.09 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  68.85 
 
 		 472 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  65.43 
 
 		 463 aa  611  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  64.18 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  65.01 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  63.91 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  63.26 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  62.5 
 
 		 482 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  64.13 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  67.46 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  61.69 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  64.13 
 
 		 464 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  67.97 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 463 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  65.44 
 
 		 471 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  63.7 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  61.26 
 
 		 492 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  61.47 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  60 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  60.22 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  61.96 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 631 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  62.12 
 
 		 463 aa  571  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  60.52 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  62.28 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  61.04 
 
 		 465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  61.04 
 
 		 462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  61.37 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  64.13 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  59 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  59 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  59.61 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.26 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  61.49 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  63.68 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  58.67 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  60.52 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  60.73 
 
 		 466 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  61.09 
 
 		 470 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.04 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 461 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  60.18 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  60.69 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  61.79 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  57.71 
 
 		 462 aa  541  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  62.83 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 465 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  58.73 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  60.74 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 460 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  62.26 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  56.74 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  56.74 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  58.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  58.86 
 
 		 458 aa  531  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>