More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2394 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  72.14 
 
 		 463 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  78.9 
 
 		 465 aa  747    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  70.41 
 
 		 463 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  79.05 
 
 		 464 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  70.84 
 
 		 463 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  70.84 
 
 		 463 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  78.62 
 
 		 464 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  100 
 
 		 462 aa  953    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  72.73 
 
 		 482 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  80.13 
 
 		 465 aa  773    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  71.3 
 
 		 466 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  71.52 
 
 		 462 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  79.57 
 
 		 465 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  78.83 
 
 		 464 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  65.23 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  65.23 
 
 		 478 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  66.01 
 
 		 472 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  64.79 
 
 		 463 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  66.02 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  66.23 
 
 		 472 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  65.14 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  65.37 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  65.58 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  64.78 
 
 		 475 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  64.43 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  63.12 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  65.44 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  61.87 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  64.78 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 461 aa  588  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  65.22 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  62.99 
 
 		 492 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  64.13 
 
 		 469 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  60.26 
 
 		 544 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  64.21 
 
 		 471 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.57 
 
 		 471 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  63.83 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  60 
 
 		 468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.92 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  59.35 
 
 		 465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  60.22 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.7 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 631 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 462 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  58.1 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 459 aa  551  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  60.91 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  58.23 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  60.3 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  56.4 
 
 		 462 aa  544  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.35 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.13 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  57.92 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 461 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  57.83 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  58.7 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  57.83 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 487 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  56.71 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  59.91 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 470 aa  531  1e-149  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  55.97 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  56.74 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  56.02 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  55.89 
 
 		 465 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>