More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1696 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  77.9 
 
 		 464 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  100 
 
 		 458 aa  922    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  73.36 
 
 		 471 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 464 aa  578  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  65.65 
 
 		 472 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  63.97 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  61.27 
 
 		 465 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  63.68 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  64.11 
 
 		 475 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  62.66 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  61.71 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  63.46 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  63.68 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  60.48 
 
 		 544 aa  560  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 461 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  65.43 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  63.72 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  64.99 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  60.93 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 463 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  64.11 
 
 		 472 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 482 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  63.46 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  63.89 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  58.95 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  63.32 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  58.73 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  61.62 
 
 		 465 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  61.71 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  58.39 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  61.27 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  59.74 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  58.21 
 
 		 471 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  59.3 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  61.66 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  60.7 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  521  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  59.26 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  58.42 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  58.33 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  56.55 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  59.96 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  56.55 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  59.3 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1755  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  58.42 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.99 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>