More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36139 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  100 
 
 		 462 aa  949    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  63.22 
 
 		 463 aa  601  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  63 
 
 		 492 aa  588  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  60.84 
 
 		 464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  61.54 
 
 		 464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  61.27 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  61.76 
 
 		 464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  60.88 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  62.33 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  61.59 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  61.67 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  60.79 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  61.98 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  60.88 
 
 		 472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  60.88 
 
 		 472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  60.79 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  61.15 
 
 		 464 aa  561  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  61.76 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  59.47 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 462 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  62.2 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  61.01 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 459 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  58.5 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  58.72 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  59.6 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  61.1 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  60 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  57.99 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  59.82 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  59.38 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.85 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  57.71 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.93 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  59.16 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  58.37 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  58.15 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  59.6 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  59.6 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  57.17 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 469 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  59.6 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  56.95 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  57.93 
 
 		 463 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 461 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 461 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  62.33 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  57.93 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  59.43 
 
 		 458 aa  541  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  57.84 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  57.27 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  57.84 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.4 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  58.81 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  58.06 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  57.62 
 
 		 465 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  59.69 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  58.54 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  57.71 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  58.15 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 475 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  56.39 
 
 		 462 aa  534  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  58.37 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  56.61 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  58.02 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  57.71 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  57.4 
 
 		 465 aa  531  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  57.71 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  59.6 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  59.34 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  57.71 
 
 		 478 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>