More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2626 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  100 
 
 		 475 aa  954    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  74.4 
 
 		 469 aa  694    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  84.25 
 
 		 469 aa  774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  74.41 
 
 		 469 aa  706    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  65.58 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  62.96 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  66 
 
 		 456 aa  564  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  63.73 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  62.12 
 
 		 461 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  62.47 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  63.32 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  62.88 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  61.49 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  60.09 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  59.07 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  61.71 
 
 		 458 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  61.4 
 
 		 458 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  60.75 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  57.99 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  56.4 
 
 		 456 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  57.71 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  59.74 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  57.8 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  59.61 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  55.43 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.83 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  55.12 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.17 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  56.39 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  53.36 
 
 		 464 aa  465  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.4 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  53.75 
 
 		 465 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  50.85 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  55.4 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  54.11 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  52.9 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  49.79 
 
 		 472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  52.78 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  52.64 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.49 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  51.88 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  51.74 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  52.69 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  53.65 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  56.73 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  51.19 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  55.07 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  51.41 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  49.45 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  53.3 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 462 aa  435  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  52.56 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  52.77 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  48.57 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  48.38 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  50.65 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.48 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.77 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>