More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0893 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  77.73 
 
 		 469 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  98.51 
 
 		 469 aa  936    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  100 
 
 		 469 aa  949    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  75.05 
 
 		 475 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 461 aa  551  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  60.87 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  59.91 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 464 aa  538  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  61.45 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  58.73 
 
 		 461 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  57.87 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 456 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  58.59 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  58.01 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  58.37 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  59.03 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  58.57 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  58.5 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 448 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  59.47 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  56.8 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  58.81 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  56.1 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  55.8 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  57.21 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  53.51 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.98 
 
 		 469 aa  481  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  55.82 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  54.25 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  57.55 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  53.73 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  52.32 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  53.98 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  53.58 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  53.12 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  52.17 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.22 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  55.61 
 
 		 471 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 469 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  50.75 
 
 		 475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  51.64 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.36 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  55.73 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  55.7 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  51.73 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  50 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  48.61 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  51.52 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  54.01 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  47.05 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  49.79 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.7 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.11 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  53.07 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  52.78 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.03 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  51.97 
 
 		 473 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.81 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  50.66 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  47.55 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.15 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  51.11 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  49.01 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  48.23 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  47.93 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  50.92 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  47.91 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  47.91 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  52.5 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  49.23 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  47.61 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  46.9 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  49.23 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  48.74 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  50.46 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  46.9 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  48.35 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  46.04 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  46.81 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>