More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4461 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  83.19 
 
 		 459 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 458 aa  925    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  86.38 
 
 		 448 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  68.91 
 
 		 463 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  82.31 
 
 		 458 aa  750    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  82.97 
 
 		 459 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  76.64 
 
 		 458 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  77.29 
 
 		 458 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  82.31 
 
 		 459 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  76.64 
 
 		 458 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  67.03 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  73.03 
 
 		 458 aa  618  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  65.36 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  66.96 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  69.3 
 
 		 458 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  64.63 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  63.44 
 
 		 461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  63.22 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  64.68 
 
 		 457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  62.11 
 
 		 461 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  60 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  61.89 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  63.56 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  61.15 
 
 		 475 aa  541  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  62.53 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  59.11 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  57.99 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  59.61 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  58.01 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  55.87 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  54.73 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.94 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  52.22 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  51.58 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  53.32 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  52.07 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  54.55 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  54.32 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  52.95 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  52.08 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.5 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  50.23 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.48 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  52.27 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  52.2 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  53.41 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  51.24 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.34 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  48.13 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.03 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  49.55 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  51.24 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  52.49 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  47.49 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  50.79 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  49.67 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  46.42 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  46.84 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  45.83 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  52.03 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  46.62 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  47.26 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  53.21 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  46.41 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  46.62 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  45.39 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  46.81 
 
 		 631 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  45.39 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  54.52 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  45.39 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  51.14 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  46.15 
 
 		 464 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  46.19 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  50.69 
 
 		 463 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  46.41 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  46.29 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  46.19 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>