More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1059 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  69.78 
 
 		 463 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  69 
 
 		 463 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  71.27 
 
 		 473 aa  653    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  71.61 
 
 		 476 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  69.41 
 
 		 471 aa  638    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  71.68 
 
 		 462 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  69.51 
 
 		 473 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  72.29 
 
 		 472 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  100 
 
 		 465 aa  938    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  69.48 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  68.27 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  69.11 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  67.97 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  68.91 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 475 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  69.28 
 
 		 463 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  69.52 
 
 		 472 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  66.95 
 
 		 466 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  69.55 
 
 		 473 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  66.31 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  67.76 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  69.72 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  69.37 
 
 		 464 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  67.54 
 
 		 465 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  64.33 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  63.12 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  63.12 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 469 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  63.12 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  62.66 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  61.42 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  61.79 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  58.67 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  58.64 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  54.86 
 
 		 467 aa  481  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  54.47 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.54 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.88 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  54.92 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.16 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  54.21 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  51.62 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.16 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.37 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.25 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 461 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.59 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 461 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  54.09 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  48.93 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  50 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  46.64 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.88 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  50 
 
 		 467 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  52.86 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  50 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>