More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0459 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  72.55 
 
 		 463 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  71.24 
 
 		 466 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  67.53 
 
 		 473 aa  638    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  74.95 
 
 		 464 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  69.8 
 
 		 473 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  68.11 
 
 		 465 aa  651    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  945    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  69.8 
 
 		 465 aa  643    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  73.14 
 
 		 473 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  68.97 
 
 		 475 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  75.65 
 
 		 464 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  75.55 
 
 		 463 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  71.46 
 
 		 466 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  68.05 
 
 		 471 aa  644    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  75.82 
 
 		 472 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  71.33 
 
 		 476 aa  652    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  70.74 
 
 		 471 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  75.55 
 
 		 463 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  69.05 
 
 		 473 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  73.46 
 
 		 472 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  85.93 
 
 		 462 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  76.09 
 
 		 464 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  68.2 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69 
 
 		 465 aa  626  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  70.02 
 
 		 473 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  67.82 
 
 		 466 aa  614  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  65.94 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  67.9 
 
 		 473 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  67.9 
 
 		 473 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  67.9 
 
 		 473 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 464 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  65.94 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  65.14 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  60.26 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  57.27 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.76 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  54.98 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  55.41 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  57.43 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  57.08 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  54.55 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  56.75 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  55.29 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  57.24 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  57.68 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  51.58 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 475 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  53.68 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  55.2 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.03 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  54.08 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  53.42 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  52.86 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.66 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  51.7 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.7 
 
 		 461 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  53.05 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.98 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  51.42 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  51.81 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.03 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.81 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  49.89 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 466 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.32 
 
 		 463 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  49.47 
 
 		 465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  49.04 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>