More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5854 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  100 
 
 
440 aa  880    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  56.75 
 
 
463 aa  501  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  59.27 
 
 
464 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  55.23 
 
 
462 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  58.41 
 
 
463 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  55 
 
 
464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  56.36 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  55.76 
 
 
472 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  56.45 
 
 
465 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  57.14 
 
 
472 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  52.49 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  55.68 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  55.23 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  55.81 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  54.75 
 
 
469 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  54.61 
 
 
473 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  55.5 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  54.21 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  56.68 
 
 
471 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  54.9 
 
 
474 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  53.67 
 
 
468 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  57.21 
 
 
463 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  51.84 
 
 
480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  54.3 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  54.75 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  56.52 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  54.75 
 
 
473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  51.37 
 
 
469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  54.75 
 
 
473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.53 
 
 
475 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  53.65 
 
 
472 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  52.87 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.27 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  54.38 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  54.87 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  55.88 
 
 
476 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  55.24 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  55.76 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  53.9 
 
 
463 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  53.3 
 
 
473 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  51.38 
 
 
469 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.73 
 
 
462 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  52.52 
 
 
472 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.75 
 
 
472 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  51.83 
 
 
465 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.1 
 
 
469 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.35 
 
 
463 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  52.98 
 
 
469 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  53.17 
 
 
472 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  50.79 
 
 
470 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  53.64 
 
 
473 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.26 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  53.21 
 
 
469 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50.23 
 
 
467 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  52.08 
 
 
469 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  49.77 
 
 
464 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.83 
 
 
463 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  53.49 
 
 
469 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  50.35 
 
 
457 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  50.35 
 
 
457 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.54 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.15 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  49.76 
 
 
469 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  48.39 
 
 
465 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  54.67 
 
 
464 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  49.89 
 
 
464 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  51.77 
 
 
462 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  49.66 
 
 
474 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  49.54 
 
 
475 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.11 
 
 
631 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50.23 
 
 
463 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  51.97 
 
 
456 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  48.62 
 
 
465 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  48.04 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  48.5 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.65 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  49.66 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  48.39 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  48.17 
 
 
510 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  49.76 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  48.39 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  48.04 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  50.11 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  50 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  48.85 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  49.65 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  50 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  49.65 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.35 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  48.17 
 
 
465 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.66 
 
 
459 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  48.62 
 
 
470 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  47.94 
 
 
461 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  48.04 
 
 
460 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  50.59 
 
 
456 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>