More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1812 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  92.7 
 
 
480 aa  891    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  78.59 
 
 
475 aa  758    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  100 
 
 
469 aa  955    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  81.84 
 
 
468 aa  798    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  81.88 
 
 
469 aa  798    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  57.36 
 
 
468 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  60 
 
 
459 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  57.97 
 
 
467 aa  531  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  55.87 
 
 
472 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  55.41 
 
 
463 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  55.48 
 
 
462 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  54.35 
 
 
464 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  54.78 
 
 
466 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  53.91 
 
 
464 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  53.91 
 
 
464 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  53.91 
 
 
464 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  53.7 
 
 
464 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  53.91 
 
 
464 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.88 
 
 
463 aa  497  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  53.91 
 
 
464 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  52.81 
 
 
465 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  52.61 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.58 
 
 
464 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.48 
 
 
631 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  55.05 
 
 
463 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  52.75 
 
 
467 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.97 
 
 
461 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.97 
 
 
461 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  52.74 
 
 
462 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  52.97 
 
 
467 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.31 
 
 
461 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.84 
 
 
469 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  52.97 
 
 
467 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.4 
 
 
474 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  52.08 
 
 
465 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  52.09 
 
 
467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  52.75 
 
 
467 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  52.17 
 
 
510 aa  483  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  52.75 
 
 
467 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  53.7 
 
 
466 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  52.75 
 
 
467 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  52.09 
 
 
467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  52.09 
 
 
467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  54.78 
 
 
464 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  52.75 
 
 
467 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  52.75 
 
 
467 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  52.09 
 
 
467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  52.09 
 
 
467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  55.44 
 
 
472 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.65 
 
 
464 aa  478  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.48 
 
 
463 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.7 
 
 
463 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  53.22 
 
 
464 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  53.95 
 
 
464 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  51.08 
 
 
466 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  49.78 
 
 
471 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  52.53 
 
 
467 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  50.88 
 
 
462 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.09 
 
 
463 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  51.32 
 
 
464 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  51.21 
 
 
465 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  49.89 
 
 
459 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  54.05 
 
 
474 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  50.66 
 
 
462 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  51.88 
 
 
462 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2328  fumarate hydratase  53.29 
 
 
479 aa  475  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  52.83 
 
 
467 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.98 
 
 
464 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  52.17 
 
 
465 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.75 
 
 
461 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  50.99 
 
 
465 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  50.77 
 
 
462 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.65 
 
 
470 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  49.45 
 
 
459 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  53.07 
 
 
464 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  51.66 
 
 
465 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50.22 
 
 
465 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  51.87 
 
 
466 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  50.77 
 
 
465 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.43 
 
 
463 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  51.21 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  50.55 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.09 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  53.02 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  52.72 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>