More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0025 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  100 
 
 
465 aa  935    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  76.3 
 
 
462 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  71.87 
 
 
456 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  67.1 
 
 
469 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  63.25 
 
 
460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  64.16 
 
 
469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  65.35 
 
 
459 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  64.11 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  63.96 
 
 
461 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  60.43 
 
 
462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  64.98 
 
 
459 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  64.76 
 
 
459 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  61.73 
 
 
457 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  64.4 
 
 
458 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  63.22 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  64.54 
 
 
459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  63.08 
 
 
461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  64.1 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  65.12 
 
 
458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  64.76 
 
 
458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  62.64 
 
 
461 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  59.91 
 
 
469 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.63 
 
 
464 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  62.72 
 
 
448 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  60 
 
 
456 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  61.09 
 
 
463 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  59.91 
 
 
469 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  65.27 
 
 
462 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  60.22 
 
 
458 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  61.98 
 
 
458 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  60.22 
 
 
457 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  61.32 
 
 
458 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  58.64 
 
 
463 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  58.46 
 
 
461 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  58.6 
 
 
469 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  59.42 
 
 
459 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  57.43 
 
 
463 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  56.46 
 
 
473 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  57.67 
 
 
465 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  56.09 
 
 
464 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  55.43 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  54.78 
 
 
467 aa  484  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  55.65 
 
 
471 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  55.1 
 
 
466 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  56.83 
 
 
464 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  57.14 
 
 
473 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  56.58 
 
 
472 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  55.09 
 
 
468 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  53.66 
 
 
457 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  57.11 
 
 
476 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  56.39 
 
 
465 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  54.05 
 
 
471 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  53.17 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  55.14 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.18 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  53.46 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  55.12 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  53.65 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  56.95 
 
 
472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  56.54 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  57.96 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  52.46 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  54.05 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  54.05 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  50.54 
 
 
480 aa  461  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  48.79 
 
 
464 aa  463  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.99 
 
 
472 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  51.7 
 
 
469 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.77 
 
 
472 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.73 
 
 
468 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  55.48 
 
 
463 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  52.89 
 
 
459 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  54.05 
 
 
473 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  57.37 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  55.19 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  55.31 
 
 
466 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  49.67 
 
 
463 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  56.18 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  56.9 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  48.57 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  50.43 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  51.11 
 
 
469 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  56.58 
 
 
463 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  48.13 
 
 
462 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.03 
 
 
459 aa  448  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  47.69 
 
 
461 aa  448  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  52.63 
 
 
473 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 
469 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  55.43 
 
 
463 aa  448  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  47.91 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  49.68 
 
 
475 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  50.43 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.81 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  49.35 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  48.57 
 
 
466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  47.91 
 
 
461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  47.91 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  54.77 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  48.13 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>