More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1384 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  100 
 
 		 464 aa  949    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  61.28 
 
 		 456 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  60.53 
 
 		 462 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  57.63 
 
 		 465 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  60 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  60 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 469 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  56.92 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  56.36 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 475 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 462 aa  531  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  58.61 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  58.08 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  57.94 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  56.05 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  55.97 
 
 		 457 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  57.33 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  55.75 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  57.71 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  53.85 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  56.44 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.53 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50.32 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  50 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.34 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  50.67 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  48.92 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  52.68 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  52.01 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  48.91 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.45 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  52.64 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  52.68 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.11 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  52.14 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  47.83 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  51.44 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  50.78 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  46.39 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  48.34 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  48.25 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  49.45 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  49.78 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  47.35 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  51.54 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  47.57 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  47.57 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  47.57 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  47.57 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  48.12 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  46.52 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  51.44 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  47.57 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  45.95 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  47.57 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  51.44 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  47.57 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  51.44 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  46.9 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  47.68 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  48.12 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  47.35 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  47.9 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  47.68 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  48.12 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  45.77 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  47.9 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  49.33 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  49.1 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  46.39 
 
 		 631 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  46.39 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  47.67 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  46.39 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  46.39 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>