More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0822 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  100 
 
 		 457 aa  924    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  66.67 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  62.96 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  64.68 
 
 		 459 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  65.78 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  64.24 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  64.24 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  62.39 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  64.68 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  64.49 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  63.58 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  65.2 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  61.37 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  64.98 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  61.86 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  60.93 
 
 		 469 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  61.23 
 
 		 459 aa  521  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  58.31 
 
 		 461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  59.42 
 
 		 465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  61.2 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  58.94 
 
 		 460 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  57.93 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.37 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  57.87 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  57.14 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  55.21 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  55.09 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  56.58 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  53.06 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.29 
 
 		 464 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  51.47 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  51.63 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.54 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  50.69 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  49.46 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  54.13 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  50 
 
 		 462 aa  415  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  51.47 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  48.36 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  51.35 
 
 		 465 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  51.7 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  48.38 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  52.14 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  52.82 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  44.54 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  45.79 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  49.78 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  46.83 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  50 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  46.24 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  45.75 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  44.76 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  47.16 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  49.25 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  44.32 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  49.14 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  45.51 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  46.39 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  46.55 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  46.3 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  45.65 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  44.9 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  45.51 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  44.1 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  49.03 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  44.71 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  43.89 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  46.55 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  48.13 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  44.13 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>