More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0720 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 463 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  100 
 
 		 464 aa  924    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  69.43 
 
 		 463 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  78.92 
 
 		 465 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  67.17 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  70.56 
 
 		 464 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  68.63 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  68.64 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  68.19 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  66.01 
 
 		 464 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  67.17 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  66.96 
 
 		 466 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  65.81 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  67.61 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  64.85 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  64.44 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  63.36 
 
 		 475 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  68.48 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  65.72 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  63.16 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  62.66 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  64.92 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  64.01 
 
 		 474 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  65.94 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  65.72 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  64.5 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 473 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  62.36 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  63.99 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  64.25 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  61.79 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  55.73 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  58.68 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.18 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  56.61 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  58.13 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  55.38 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  59.53 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.49 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.06 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  50.87 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  54.67 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  441  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.63 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.02 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.02 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.65 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  49.35 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  49.35 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.08 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  51.52 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  51.74 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  53.66 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  54.1 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  49.01 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  48.68 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 631 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  51.2 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.55 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  53.22 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  54.52 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  52.89 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.02 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.25 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.02 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  52.99 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  52.02 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>