More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0742 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  72.23 
 
 		 473 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  72.11 
 
 		 465 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  73.5 
 
 		 471 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  73.18 
 
 		 475 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  68.05 
 
 		 463 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  70.24 
 
 		 472 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  83.33 
 
 		 473 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  84.03 
 
 		 476 aa  746    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  100 
 
 		 471 aa  952    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  75.44 
 
 		 468 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  69.37 
 
 		 462 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  73.06 
 
 		 473 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  80.34 
 
 		 473 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  69 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.41 
 
 		 465 aa  624  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  66.74 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  68.34 
 
 		 472 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  67.4 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  67.47 
 
 		 464 aa  618  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  68.93 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  68.93 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  66.74 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  65 
 
 		 465 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  64.91 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  64.4 
 
 		 466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  63.6 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  61.61 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  61.94 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  62.36 
 
 		 472 aa  548  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  61.75 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  61.75 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  61.75 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  61.4 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  63.16 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  55.65 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.8 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  52.03 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  58.11 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  54.39 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.33 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  50.65 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  53.11 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  51.72 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.39 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  50.86 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  50.86 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  51.74 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  48.86 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  50 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 468 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  51.91 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  48.53 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.66 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  50.65 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  52.87 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  48.72 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  48.93 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  48.51 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 631 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  49.36 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  49.25 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  46.97 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  49.46 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 474 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  48.82 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  48.82 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  47.12 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  48.5 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  48.88 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  48.74 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  45.22 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  48.87 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  47.84 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  47.74 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  47.84 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>