More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1669 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  84.06 
 
 		 469 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  81.25 
 
 		 474 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  86.15 
 
 		 472 aa  773    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  100 
 
 		 466 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  83.91 
 
 		 473 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  83.91 
 
 		 473 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  83.91 
 
 		 473 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  83.62 
 
 		 471 aa  746    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  67.82 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  67.38 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  66.45 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  68.78 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  65.5 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  64.99 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  64.77 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  66.08 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  65.31 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  64.33 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  65.58 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  65.23 
 
 		 463 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  65.36 
 
 		 476 aa  578  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  64.09 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  63.6 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  65.66 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  64.33 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  64.55 
 
 		 473 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  65.81 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  63.4 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  63.99 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  61.69 
 
 		 465 aa  541  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  61.26 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.01 
 
 		 480 aa  484  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  57.17 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.74 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  55.1 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  56.39 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.8 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 475 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.11 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  54.97 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  54.98 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  55.23 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.48 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.03 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  53.48 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  52.64 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.95 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  55.92 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  51.99 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.99 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.86 
 
 		 510 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  50.43 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.81 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  51.24 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.95 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.78 
 
 		 482 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 631 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.45 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.95 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.79 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.8 
 
 		 464 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  52.99 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  49.35 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  50.56 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.56 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.25 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  51.02 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  54.9 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>