More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0844 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  75.27 
 
 		 464 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  75.32 
 
 		 473 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  68.93 
 
 		 471 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  70.15 
 
 		 471 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  68.23 
 
 		 475 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  935    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  75.55 
 
 		 463 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  72.11 
 
 		 463 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  71.46 
 
 		 473 aa  667    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  92.87 
 
 		 463 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  73.36 
 
 		 464 aa  695    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  70.09 
 
 		 466 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  78.43 
 
 		 472 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  70.9 
 
 		 466 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  72.27 
 
 		 464 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  68.52 
 
 		 473 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  76.42 
 
 		 462 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  69.91 
 
 		 465 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  75.44 
 
 		 472 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  70.43 
 
 		 465 aa  656    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  70.28 
 
 		 476 aa  631  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.72 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  67.45 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  67.39 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  69.28 
 
 		 473 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  65.66 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  67.61 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 469 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  66.52 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  66.52 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  64.33 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  64.04 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  63.18 
 
 		 472 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  60.13 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  59.74 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.21 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  57.68 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  56.13 
 
 		 467 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  58.5 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.29 
 
 		 469 aa  481  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.94 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.58 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  55.76 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  53.33 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.97 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  53.97 
 
 		 461 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  52.04 
 
 		 460 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  53.97 
 
 		 461 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.69 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  53.14 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.65 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  50.21 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 463 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 631 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.26 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  49.79 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  49.79 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  51.39 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  52.04 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.39 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.35 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  48.16 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  50.9 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  51.86 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.12 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.11 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  51.7 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  51.7 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.47 
 
 		 472 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 470 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  46.96 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50.89 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  52.82 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>