More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  68.76 
 
 		 464 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  84.14 
 
 		 473 aa  763    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  70.69 
 
 		 473 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  77.23 
 
 		 471 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  69.8 
 
 		 463 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  75 
 
 		 473 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  71.68 
 
 		 472 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  72.65 
 
 		 462 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  76.71 
 
 		 475 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  100 
 
 		 473 aa  946    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  83.33 
 
 		 471 aa  795    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  75.05 
 
 		 465 aa  674    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  76.92 
 
 		 473 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  77.29 
 
 		 468 aa  709    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  87.23 
 
 		 476 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  71.27 
 
 		 465 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  69.13 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  70.37 
 
 		 463 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  71.46 
 
 		 463 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  70.15 
 
 		 472 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  68.85 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  67.69 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  70.02 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  66.52 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  64.77 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  65.87 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  64.27 
 
 		 471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  63.11 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  63.44 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  63.64 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  63.42 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  63.42 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  62.75 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.67 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  57.3 
 
 		 456 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  58.86 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  54.21 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  54.7 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.13 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  52.79 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.72 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.15 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  55.33 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  51.61 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.37 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  51.64 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  51.18 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  51.94 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.11 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  52.69 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  48.42 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  52.27 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  50.76 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  49.33 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  49.89 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.77 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  49.89 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  49.33 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 631 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  49.56 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  49.66 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  48.69 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  49.33 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  52.5 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  51.62 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  50.57 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>